Ministerská konferencia (Ministerial Conference) je najvyšším orgánom WTO. Uskutočňuje sa najmenej raz za dva roky. Má výhradné právo prijímať rozhodnutia ku všetkým otázkam multilaterálneho obchodného systému a k dohodám, ktoré sú záväzné pre členov tejto organizácie. Výsledky ministerských konferencií sú sformulované v záverečných ministerských deklaráciách. V doterajšej histórii WTO sa uskutočnilo šesť ministerských konferencií.
Generálna rada (General Council) má na starosti chod WTO v čase medzi ministerskými konferenciami. Jej sídlo je v Ženeve a stretáva sa niekoľkokrát do roka. Na stretnutiach sa zväčša zúčastňujú veľvyslanci členských krajín WTO. V rámci generálnej rady existujú 3 samostatné orgány – Generálna rada (General Council), Orgán WTO pre prehľad obchodných politík (Trade Policy Review Body – TPRB) a Orgán na urovnávanie sporov (Dispute Settlement Body). Generálna rada zastrešuje prácu rôznych rád a výborov, ktoré sa venujú špecifickým oblastiam obchodu.
Na základe deklarácie z Dohy z novembra 2001 bol vytvorený Výbor pre obchodné rokovania (Trade Negotiations Committee – TNC). Má na starosti rokovania v rámci nového kola rokovaní, tzv. rozvojovej agendy z Dohy. TNC rokuje na základe právomocí generálnej rady. Jeho predsedom je generálny riaditeľ.
Prísnejšie pravidlá a vyššie sankcie za nedodržanie GDPR
GDPR predstavuje nový právny rámec ochrany osobných údajov na európskej úrovni. Jeho cieľom je predovšetkým chrániť práva občanov Európskej únie proti neoprávnenému spracovávaniu s ich osobnými alebo citlivými údajmi. Spoločnosť Safedata.sk ponúka od roku 2018 vypracovanie GDPR dokumentácie pre malé a stredné spoločnosti. Európske GDPR nariadenie zaviedlo nové pravidlá, ktoré naviac sprísnili výškami pokút.
Sekretariát WTO má sídlo v Ženeve. Jeho úlohou je poskytovať technickú a profesionálnu pomoc jednotlivým výborom a radám WTO, technickú asistenciu rozvojovým krajinám, monitorovať vývoj svetového obchodu, poskytovať informácie verejnosti a organizovať ministerské konferencie. Na čele sekretariátu WTO stojí generálny riaditeľ, ktorý je volený na 4-ročné funkčné obdobie. Od 1. septembra 2005 je generálnym riaditeľom Pascal Lamy.
Pracovnými jazykmi WTO sú angličtina, francúzština a španielčina.